一、原理不同

大脑锻炼法的原理是基于《神经物理学》，认为大脑的智力是由大脑的功能决定的，大脑的功能是由大脑的活度决定的。造成大脑活度不高的原因可能来至遗传、发育和疾病。提高智力的根本在于改善大脑的功能，提高大脑的活度。

左右脑开发和全脑开发是基于大脑的分工不同。认为左右脑之间各有各的分工。如果对左脑进行开发，就多做一些左脑分工的事情，如果对右脑进行开发，就多做一些右脑分工的事情。如果是全脑开发，就对左右脑分工的活动分别进行。

二、开发的方式不同

大脑锻炼法是针对低活度的脑组织细胞展开的。直接找到有隐痛的低活度脑组织进行锻炼，直到其恢复健康。

左右脑开发和全脑开发是在不知问题产生部位的情况下，多做一些用脑的事情，让大脑在工作中自己变得强大起来。

三、验证方式不同

大脑锻炼法的锻炼效果是可验证的。验证的方法是隐痛的消失和转移。每一次课程之后都要留下足够的时间让学生自己锻炼，直到当前锻炼的隐痛消失，新的隐痛出现。这些验证和感受是由学员自己进行的。

而左右脑和全脑开发没有这样的验证体验。

四、效果不同

锻炼大脑的对大脑功能问题的根本解决。参加大脑锻炼的学生经过一段时间的开发，大脑当中的隐痛消失了，大脑的整体功能得到提升，无论智商还是情商都会得到提升。